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<object id="z4esy"></object> mRNA的表達水平很大程度上可以反應個體內基因的表達特性，不同個體，不同發育階段，不同組織的表達水平可能各不相同。轉錄組測序（RNA-seq）憑借高通量、價格低、周期短、應用范圍廣等優勢，已經成為研究生物基因表達的一種重要工具，深受科研人員的青睞。 那么如何利用小樣本量進行轉錄組測序實驗設計，才能獲得更有價值的研究呢？下面就以幾篇項目文章為例，為大家奉上小樣本的轉錄組研究思路，通過簡單的轉錄組測序發揮錦上添花的效果，讓您的實驗數據更加充實有力，助力高分文章。 ★ 研究思路1★轉錄組測序-發現關鍵基因項目文章：Combined Transcriptome and Metabolome Analysis Reveals That the Potent Antifungal Pyrylium Salt Inhibits Mitochondrial Complex I in Candida albicans發表期刊：Microbiology Spectrum影響因子：9.043合作單位：海軍軍醫大學/同濟大學附屬第十人民醫院樣本類型：白色念珠菌（n=6）研究內容：在對SM21進行結構修飾的基礎上，合成了具有增強抗真菌活性的新型丙酮酸鹽衍生物xy12。xy12對白色念珠菌的MIC值（MIC90）范圍為0.125-0.25mg/mL，比SM21低約2倍。通過RNA-seq技術，在xy12處理的白色念珠菌中共鑒定出3454個差異表達基因，通過整合KEGG途徑富集分析，我們發現抑制氧化磷酸化是xy12的重要抗真菌作用機制。通過線粒體呼吸復合物I至IV的電子傳輸是氧化磷酸化的常見過程。野生型SC5314的敏感性和xy12相比，線粒體復合體I（CI）缺陷突變體的敏感性降低，表明xy12的抗真菌作用依賴于CI，同時，xy12處理的白色念珠菌的表型與CI缺陷突變體相似�？傊�，結果表明，xy12可以通過抑制白色念珠菌中的線粒體復合物I來抑制氧化磷酸化，為線粒體靶向抗真菌藥物的開發提供了一種新的先導化合物。轉錄組測序結果展示： 項目文章：Molecular mechanisms of atrazine toxicity on H19-7 hippocampal neurons revealed by integrated miRNA and mRNA “omics”發表期刊：Ecotoxicology and Environmental Safety影響因子：7.129合作單位：徐州醫科大學樣本類型：大鼠海馬衍生的H19-7細胞（n=6）研究內容：阿特拉津（ATR）是一種在亞洲和南美洲廣泛應用的除草劑，其自然降解緩慢，并對人類和動物健康產生有害影響，包括海馬毒性。然而，對ATR誘導的海馬損傷的分子機制知之甚少。因此作者分析了大鼠海馬衍生的H19-7細胞對ATR（500μM）的反應的mRNA和miRNA表達譜，GO分析表明，這些DEMs富含與突觸可塑性和抗氧化能力相關的基因，而KEGG分析表明，富集的DEMs參與鈣信號傳導、軸突引導、MAPK信號傳導和膠質細胞癌變。本文鑒定的miRNA-mRNA調控網絡可能為ATR誘導的海馬神經毒性治療提供潛在的生物標志物和新的策略。轉錄組測序結果展示： 項目文章：Long‐Term High‐Fat Diet Decreases Renal Insulin‐Degrading Enzyme Expression and Function by Inhibiting the PPARγ Pathway發表期刊：Molecular Nutrition & Food Research影響因子：6.575合作單位：重慶醫科大學附屬第三醫院樣本類型：小鼠腎臟組織（n=6）研究內容：長期高脂肪飲食（HFD）導致胰島素抵抗，這是肥胖和2型糖尿病發展的主要病因。胰島素清除受損不僅是胰島素抵抗的后果，也是胰島素抵抗的原因。腎臟是胰島素清除的主要部位，其中胰島素降解酶（IDE）在近端小管中起著至關重要的作用。因此，我們研究了腎IDE在HFD誘導的肥胖小鼠胰島素抵抗調節中的作用。RNA-Seq分析發現PPAR途徑參與其中，腎PPARγ表達降低。PPARγ激動劑羅格列酮可阻止棕櫚酸對IDE表達的抑制。在棕櫚酸處理的細胞中，與IDE啟動子結合的PPARγ的量減少。羅格列酮改善了HFD喂養小鼠的胰島素清除率和胰島素抵抗，并增加了腎IDE的表達。轉錄組測序結果展示： ★ 研究思路2★轉錄組測序--轉錄水平的驗證項目文章：Interfering biosynthesis by nanoscale metal-organic frameworks for enhanced radiation therapy發表期刊：Biomaterials影響因子：15.304合作單位：上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院/上海市傷骨科研究所樣本類型：人骨肉瘤細胞系（n=6）研究內容：放射治療(RT)是應用最廣泛的癌癥治療方法之一。然而，腫瘤細胞旺盛的生物合成對RT抵抗性起著重要作用。在此，本研究合成了一種多功能的鉿基金屬有機框架（Hf-nMOFs），并負載了3-BrPA（3-BrPA@Hf-nMOFs，縮寫為BHT）用于生物合成靶向放療增敏。同時，利用轉錄組技術對細胞代謝和生物合成中的上調和下調基因以及相關通路進行了研究，揭示BHT的放射增敏機制。這項研究為解決放療瓶頸提供了新的方法和策略，也為合理開發創新和高效的輻射增敏試劑提供了概念框架。轉錄組測序結果展示： 項目文章：Ga-containing Ti alloy with improved osseointegration for bone regeneration: In vitro and in vivo studies發表期刊：Composites Part B-Engineering影響因子：11.322合作單位：上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院/南京醫科大學兒童醫院樣本類型：大鼠骨髓間充質干細胞（BMSCs）（n=6）研究內容：鈦和鈦合金因其優異的機械財產、耐磨性和生物相容性而被廣泛應用于臨床骨科植入材料。然而，鈦合金的治療效果受到其骨整合不良的限制。因此，本研究旨在通過制造含不同Ga量的鈦合金來改善骨整合不良。評估了Ti–Ga合金的財產，包括元素分布、硬度和鈣鹽沉積。結果表明，Ga作為一種生物活性金屬，促進了磷灰石的形成。分別使用大鼠骨髓間充質干細胞（BMSCs）和大鼠髓內釘模型在體外和體內評估了Ti–Ga合金的成骨性能。生物學結果表明，Ti–Ga合金為細胞粘附和擴散提供了合適的條件，促進了BMSCs的成骨分化，并比純Ti更好地增強了體內骨整合。轉錄組學結果進一步表明，Ga通過下調gremlin表達增強了骨整合。本研究介紹了Ti-Ga合金作為具有比純鈦更好的骨整合的有前途的植入材料，并闡明了Ga促進成骨的可能機制。轉錄組測序結果展示： 項目文章：A prospective diagnostic and prognostic biomarker for hepatocellular carcinoma that functions in glucose metabolism regulation: Solute carrier family 37 member 3發表期刊：BBA - Molecular Basis of Disease影響因子：6.633合作單位：天津醫科大學朱憲彝紀念醫院樣本類型：人肝細胞癌細胞系（n=6）研究內容：肝細胞癌（HCC）是最常見的癌癥類型。由于HCC發病隱匿，早期診斷相對困難。HCC對一線治療藥物也表現出強烈的耐藥性。因此，迫切需要新的精確診斷和預測HCC的生物標志物。作者采用生物信息學分析、體外細胞功能實驗和體內異種移植腫瘤模型的組合方法，系統地研究溶質載體家族37成員3（SLC37A3）在HCC進展中的作用。SLC37A3敲低的HCC細胞的RNA-seq分析表明，1型糖尿�。═1DM）相關的信號通路顯著改變。胰島素分泌相關基因和糖酵解/糖異生相關基因的表達水平也發生了變化，表明SLC37A3可能參與葡萄糖穩態的調節�？傊�，SLC37A3是HCC的前瞻性診斷和預后生物標志物，在糖代謝調節中發揮作用。轉錄組測序結果展示： 中科優品推薦【中科新生命】具有豐富的轉錄組項目經驗，建立了完整的多組學服務平臺，通過多組學生物信息學報告的剖析和引導，能夠幫助老師們從龐大而又復雜的多組學數據中迅速理出線索，充分利用好組學大數據帶來的系統生物學信息。...
2023EBC第八屆易貿生物產業大會暨易貿生物產業展覽于18-19日兩天在蘇州國際博覽中心順利舉行。本屆會議規�？涨�，現場參會人數達22752。本次會議組織了60+論壇，50+圓桌論壇、27場頭腦風暴、5場閉門構成豐富的會議內容。作為開年的第一場行業盛會，艾貝泰攜眾多產品盛裝出席了本次會議。除熱銷產品外，更有多個產品是首次亮相。艾貝泰現場展示了：Sepragen徑向層析系統和層析柱、Cytena克隆篩選單細胞分選系統、細胞計數儀、一次性生物反應器、接管機、封管機、波浪式生物反應器、一次性袋子等。每個產品都配備了專業技術人員現場講解，吸引了不少參會人員前來咨詢了解。展位的抽獎活動更是吸引了一大波粉絲，展位熱鬧非凡。展會現場回顧展會預告：下一站：珠�！ぶ袊镏破纺陼–BioPC），艾貝泰展位號—Q21，期待與大家再次相聚！屆時艾貝泰將攜更多新品亮相會場。...
2023年3月15日，首都醫科大學藥學院與美谷分子儀器（上海）有限公司在首都醫科大學科研北樓舉行共建示范實驗室揭牌儀式。首都醫科大學藥學院院長王玉記教授、美谷分子儀器（上海）有限公司總經理周偉等出席了揭牌儀式。首都醫科大學藥學院&美谷分子儀器共建示范實驗室揭牌儀式首都醫科大學藥學院院長王玉記教授介紹了首都醫科大學藥學院概況、研究領域及科研成果。首都醫科大學建校于1960年，是北京市重點高等院校，是北京市政府、國家衛生健康委員會、教育部共建院校。2004年，首都醫科大學藥學院成立，著名藥物化學家彭師奇教授為首任院長。建院以來，藥學院針對血栓、腫瘤、退行性疾病等開展預防、治療和顯影等藥物的研究，現有藥學、臨床藥學2個國家雙yiliu專業、2門國家ji yiliu課程、國家ji虛擬仿真實驗教學項目、國家ji實驗教學示范中心、內源式預防藥物教育部工程研究中心以及多肽及小分子藥物北京市重點實驗室等。近年來，藥學院為解決更多臨床難題，分別成立了首都醫藥創新中心-納米藥物研究中心、藥學院-國家神經系統疾病臨床研究中心聯合實驗室、藥學院-北京同仁醫院聯合實驗室等�？茖W研究是支撐學科建設的基石。藥學院近年來發表SCI論文300余篇，授權專利220余項，開展國家ji課題47項和省部級課題33項。其中依托首都醫科大學開展了一系列針對小分子及納米血栓、腫瘤、免疫藥物研究和基因及藥物納米遞送系統的開發，以期提高藥效、降低毒性和提高組織與藥物靶向性，部分成果已經完成轉化。首都醫科大學藥學院院長 王玉記教授美谷分子儀器總經理周偉向與會人員介紹了美谷分子儀器（上海）有限公司概況。美谷分子儀器（Molecular Devices）隸屬于丹納赫生命科學平臺，創立于1983年的美國硅谷，致力提供生命科學研究、制藥及生物治療開發等領域蛋白和細胞生物學的創新性生物分析解決方案與產品。針對藥物開發的早期階段，美谷分子儀器基于微孔板的高通量檢測與分析為全球生命科學實驗室的研究者們提供酶標儀、高內涵細胞成像分析、克隆篩選、電生理儀器等高通量產品。另外，隨著抗癌藥物篩選、藥物毒性分析、尋找潛在治療靶點成為腫瘤類器官研究的熱點領域。美谷分子儀器加速了3D/類器官研究領域布局，與丹納赫生命科學平臺其他公司一起提供針對類器官研究從類器官制備到鑒定，以及后續延申的科研應用的完整解決方案。其中，ImageXpress Confocal HT.AI智能型共聚焦高內涵成像與分析平臺，在藥效鑒定、藥毒性篩查、科學研究中提供各種類型類器官模型高通量成像與3D分析。美谷分子儀器不僅僅是“In China for China”，而是“In China for Global”。加入丹納赫之前，美谷分子儀器在中國擁有自己的生產基地，并成立了研發團隊。目前全球供應的產品里面70%多是在上海工廠生產的。美谷分子儀器將持續深耕本土化戰略，不僅是把產品放在中國生產，而是同中國用戶走得更近，來了解未被滿足的需求。今天的共建示范實驗室就是其中關鍵一步，與中國科學家攜手共進，打造更高端的儀器。美谷分子儀器（上海）有限公司總經理 周偉全球新冠疫情爆發后，中國生物醫藥及相關行業異�；钴S，同時也面臨著新的國際和國內形勢和挑戰。為了響應國家大健康的號召，打破以往科學儀器公司與科研院校實驗室的“買賣”模式，探索“科學家+科學儀器”合作新載體，首都醫科大學藥學院和美谷分子儀器（上海）有限公司共建示范實驗室，以期為全民健康和生物醫藥行業做出更多、更強的成果。實驗室參觀...
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